Cellectis publie un article scientifique dévoilant trois facteurs clés pour une édition efficace avec des TALE base editors

Cellectis, société de biotechnologie de stade clinique, qui utilise sa technologie pionnière d'édition de génome TALEN pour développer de potentielles thérapies innovantes pour le traitement de maladies graves, a annoncé aujourd'hui la publication d'un article scientifique dans Scientific Reports, démontrant comment trois facteurs clés peuvent être déterminants pour une édition efficace avec des TALE base editors.

Les TALE base editors sont un ajout récent et important au domaine de l'édition du génome. De par leur conception, les TALE base editors ne créent pas de rupture dans les brins d'ADN comme le font CRISPR/Cas9 ou d'autres nucléases ingénierées, et constituent une stratégie thérapeutique prometteuse pour les maladies génétiques. Un aspect essentiel pour élargir le champ des applications possibles est notre compréhension des règles de conception.

Les TALE base editors reposent sur la modification des cytidines dans l'ADN à double brin, entraînant la formation d'un intermédiaire d'uracile (U). Ces outils moléculaires sont des fusions entre des domaines protéiques de "transcription activator-like effector" (TALE) responsables de la liaison de séquences d'ADN spécifiques, et des moitiés de désaminases split-DddA qui, après reconstitution du domaine catalytique, initieront la conversion d'une cytosine (C) en thymine (T), et un inhibiteur de l'uracile glycosylase (UGI).

Des travaux précédents ont démontré que le positionnement de la cytosine ciblée est un facteur déterminant pour une édition efficace.

Afin d'approfondir la compréhension des facteurs déterminants permettant une édition efficace par les TALE base editors (conversion C-to-T), Cellectis a cherché à savoir si la nature (longueur et composition) du linker qui relie le domaine TALE aux têtes catalytiques de la désaminase pouvait avoir un impact sur la conversion C-to-T au sein de la fenêtre d'édition.

L'ensemble de données présentées dans cet article montre comment trois facteurs clés, la longueur de la liaison, l'architecture du TALE base editor et la composition des bases environnantes, peuvent avoir un impact sur les résultats de l'édition et nous permettent d'améliorer notre compréhension de l'activité et de la spécificité du TALE base editor, ce qui permettra d'ajuster et de contrôler l'édition.

"Cette stratégie expérimentale utilisée par Cellectis pour caractériser en détail des profils d'édition et dans un format à haut débit pourrait facilement être appliquée à tout nouvel éditeur afin de continuer à développer cette plateforme pour des applications thérapeutiques potentielles" a déclaré Maria Feola, Scientist III, Manager, Gene Editing à Cellectis.

Les données de la recherche soulignent en particulier l'importance primordiale des positions précédant le CT ciblé, qui augmentent considérablement l'efficacité de l'édition.